成立目的：

聖神修院神哲學院於1970年成立，乃一所專為研究神哲學的學術中心，目的是為給有志獻身司鐸職務的人士、修道人以及平信徒提供神哲學的訓練。學院架構於2025年改組，分立三所新的學院：聖神神學院、聖神哲學院、聖神宗教學院，各自獨立處理相關課程的學術事宜。而原來的聖神修院神哲學院，則會為三間新學院提供資源、行政、校園設施等支援。

發展：

學院當年的創立，是為聖神修院的修生提供神哲學培訓。聖神修院前身是華南總修院（一九三一年至一九六四年），總修院之興建是為培育華南地區國籍神職人員，讓他們於晉鐸後， 服務所屬教區。華南地區包括韶關、梧州、廣州、江門、嘉應、汕頭、汀州、廈門、福州、建寧、福寧、北海、瓊縣和香港等教區。然而，除了香港外，上述各教區，鑑於環境變遷， 自一九六四年後，再沒有派修士到來接受培育。於是，傳信部解散總修院，並將修院院址交由香港教區使用。是年，香港教區就在總修院院址開辦教區大修院，即現今的聖神修院， 落實了梵蒂岡第二屆大公會議，有關修士與神職人員該在他們所屬地區接受培育的指示。

隨後，為了配合地方教會發展上的需要，學院也開始為平信徒提供神哲學的訓練，並在學術方面精益求精，不斷持續發展：

	年份	事項
	1970	聖神修院神哲學院成立，由香港教區、澳門教區、耶穌會和慈幼會合辦，1985年再邀得方濟會加入。
	1973	學院開始接受信友入讀，使他們有機會強化個人對天主的認識，及成為建設天國的有效工具。
	1974-76	神學部與哲學部先後成為羅馬宗座傳信大學屬校。從此， 該兩學部的畢業生可獲頒授神學學士學位（Bachelor of Theology）與哲學學士學位（Bachelor of Philosophy）。
	1989	為了滿全信友希望獲得神學課程學位的心願和需要，學院再向前邁進一步，開辦宗教學部， 並同樣地獲得宗座傳信大學神學院的認可，使凡依照學部要求，修畢所有課程的人士， 均可獲頒授宗教學學士學位（Bachelor in Religious Sciences）。
	1994	神學部取得了宗座傳信大學的同意，開始一個為期兩年的神學碩士學位（教義神學）課程 （Licentiate in Theology (Dogmatic Theology) Program）。 因此，神學部需要從宗座傳信大學附屬學院的地位，提升為該大學的成員學院。 1997年3月6日，公教教育部終於批准神學部升格的申請，成為宗座傳信大學神學院的成員學院。
	2025	學院於九月開始迎向一個新階段。神學部與羅馬傳信大學的成員學院關係將結束，轉而成為羅馬額我略大學神學院的成員學院，開辦頒授額我略大學神學學士和碩士學位的課程。哲學部亦籌備與額我略大學哲學部掛鉤；把原來二年制哲學文憑課程，擴展成三年制的學位課程。至於宗教學部，同樣將結束與羅馬傳信大學的關係，轉為連繫台灣聖博敏神學院，開辦頒授其學位的宗教學學士課程。以上的變動經公教教育部的同意。 學院將在構架上作出相應改變，在新學年開始分立三間新的學院：聖神神學院、聖神哲學院、聖神宗教學院，各自處理相關課程的學術事宜。而原來的聖神修院神哲學院，則會為三間新學院提供資源、行政、校園設施等支援。